近期,完美生科院成功获得国家版权局颁发的两项计算机软件著作权登记证书:
16S扩增子测序分析软件
(简称RunAmplicon)
基于全基因组测序的菌株安全性分析软件
(简称WGS-StrainSecure)
这两项创新性软件著作权的获得标志着生科院在微生物组学和生物信息学领域的先进地位。完美将持续对该软件和数据库进行完善和更新,确保后续研究的高效和准确。
基因测序是探索生命健康前沿、进行现代生物医学研究的重要手段之一。随着高通量测序技术的快速发展,基于测序技术的微生物组和基因组研究已经成为现代生命健康研究的热点。
为了便于开展样本个性化分析、优化流程及方法、提升效率,完美积极投入资源并着手建设自有高通量测序及生物信息学分析平台。
Illumina MiSeq、NextSeq 2000测序仪
目前,完美生科院已建成自有高通量测序实验室 (点击查看),拥有Illumina MiSeq和NextSeq 2000测序仪,已开发16S rDNA扩增子测序和Shot-gun宏基因组测序方法,可用于肠道菌群和皮肤菌群等微生物组学研究。
为了提升各组学大数据分析能力,完美生科院“肠道微生态团队”着手开发多组学生物信息学数据分析管道。
16S rDNA
扩增子测序分析软件
通过16S rDNA扩增子测序,我们可以深入了解肠道和皮肤微生物组的特征,为保健食品和化妆品的研发提供科学依据,提高产品的效能和个性化水平。
肠道菌群和健康:研究表明,肠道菌群与人体免疫系统、代谢健康及其他生理功能密切相关。
以肠道微生物为靶点开展分析研究,将推动新型保健食品的研发,从而更好地改善肠道微生态环境、提高人体健康水平。
皮肤菌群和化妆品:皮肤菌群在维持皮肤健康和免疫功能中发挥着重要作用。
对皮肤微生物组的研究有助于了解不同皮肤类型的微生物差异,从而设计出更符合个体差异的护肤产品,提高化妆品的个性化和护肤效果。
为了更高效、准确地解读和分析16S rDNA扩增子测序产生的海量数据,生科院团队开发了分析软件“RunAmplicon”。
该软件结合稳定先进的算法和最新数据库,为研究人员提供了强大的帮助,可完成原始下机数据(Raw Data)的质量控制、生成特征表和代表序列、Alpha多样性、Beta多样性、物种组成、物种差异分析、功能预测和基于环境变量的相关性分析。
通过与多家第三方实验室比对,该流程的准确性和可靠性已得到证明。
基于全基因组测序的
菌株安全性分析软件
完美用于食品和化妆品生产的菌株需要进行严格的安全性评估,以排除具有潜在致病性或有害性的微生物菌株,确保其不会对人体造成不良影响。
常用的安全性评估方法,包括传统的实验测试和新兴的全基因组测序及生物信息学分析,其差异如下:
特点 | 实验方法评价菌株安全性 | 全基因组测序评价菌株安全性 |
适用场景 | 菌株在特定检测条件下的生物学特性 | 不受测试条件的影响 |
直接生物活性检测 | 直接测定菌株产生的毒素或对抗生素的敏感程度 | 无法提供直接的生物活性检测,可提供基因信息 |
全面性评估 | 仅限于测试范围的毒力或抗性,很难做到全面评估 | 能够提供全面的毒力和抗性基因信息 |
菌株间转移风险 | 无法判断毒力和抗性基因的潜在转移风险 | 可判断毒力和抗性基因的转移风险 |
综合实验和基因组学方法是当前食品和化妆品行业中菌株安全性评估的最佳实践。这种综合方法不仅提高了测试的灵敏性和准确性,也有助于更全面地了解菌株的生物学特性和潜在的风险。
完美对所有用于生产的菌株都将进行综合评价,结合实验方法和全基因组测序与生信分析,以确保其安全性。
在菌株基因组安全性分析方面,完美推出的分析软件“WGS-StrainSecure”能为菌株基因组中的毒力基因和抗生素抗性基因提供深度解析。
该软件采用创新性的方法,结合多个数据库,实现对潜在的毒力基因、抗生素抗性基因和可移动遗传元件的准确鉴定。通过该技术,研究人员能快速且准确地识别基因组中的风险因子,并判断这些因子在菌株之间的潜在转移风险。
通过该软件,完美的菌株生产及产品安全性得到了更好的保障。
完美生信专用服务器
上述两个软件已部署于完美生物信息学专用高端服务器集群上,可实现成百上千个原始数据的批量分析。
至此,完美生科院已具备从样本采集和前处理、DNA提取和建库、上机测序及下机数据分析的全流程研发能力,为科学研究赋能产品打下了坚实基础。
完美自有高通量测序实验室及配套多组学生物信息数据分析管道的建成,有效促进了完美在微生态、活性肽、天然产物等生物领域的开发,为健康产品、化妆品研发提供了科学依据。
两项软件著作权的获得是完美科技创新的成功案例,也是对完美在生命科学和生物信息学领域先进地位的进一步确认。生科院将以更高的热情和专业精神,为广大同行提供卓越的定制化服务和技术支持,促进学术交流,助力科研人员开展创新性研究。